Фамилия Сейбаковик напрямую связана с местом жительства предка. В её основе лежит название села Сейбаки в Лидском районе Гродненской области Белоруссии. Человек, первым получивший такое прозвище, скорее всего, был уроженцем этого населённого пункта, и односельчане называли его по месту происхождения.

Словообразовательная модель здесь прозрачна и типична для белорусских и польских земель. К основе «Сейбак-» добавили суффикс «-овик», который в славянской ономастике часто указывает на принадлежность к роду или месту. Если бы фамилия формировалась по великорусской модели, мы бы увидели форму «Сейбаков» — с суффиксом «-ов». Форма «-овик» — характерный маркер западных регионов, где переплелись белорусские и польские традиции имянаречения. В польском языке аналогично строятся фамилии вроде Висловик или Грудовик.

Само название села Сейбаки имеет балтские корни. В этих местах исторически жили литвины и ятвяги, и топоним, вероятно, связан с литовским словом «seibėti» — слабеть, чахнуть, либо с древним балтским именем Сейбут. Поэтому фамилия хранит след сразу двух культурных пластов: балтской топонимики и славянской модели фамильного суффикса.

В письменных источниках фамилия встречается в латинизированной форме Seibakovic, что характерно для документов XIX — начала XX века, когда белорусские земли входили в состав Российской империи, но местное население часто использовало польскую орфографию. В русскоязычной записи фамилия закрепилась как Сейбаковик, с ударением, предположительно, на последний слог, как это свойственно белорусским фамилиям с суффиксом «-ик».

Носители фамилии и сегодня встречаются преимущественно в Гродненской области и среди потомков эмигрантов из этих мест. Фамилия осталась редкой, не разошлась широко по России, что подтверждает её узкую географическую привязку к конкретному селу. По сути, каждый Сейбаковик — дальний родственник, чей общий предок когда-то покинул Сейбаки или продолжал жить в них, но получил прозвище, закрепившееся за его потомками.