Фамилия Сейсембекова — тюркская по происхождению, а точнее казахская, и её разбор ведёт к двум ключевым компонентам: мужскому имени Сейсембек и русскому патронимическому суффиксу -ов, адаптированному через женскую форму -а. Основа — Сейсембек — составное имя, распространённое у казахов и других тюркских народов. Первая часть, «Сейсем», восходит к арабскому «Сейсем» (вариант «Сейсен»), что означает «вторник» — день недели, который в мусульманской традиции считался удачным для рождения ребёнка. Вторая часть, «бек», — тюркский титул, обозначающий князя, господина или знатного человека. Вместе имя Сейсембек можно перевести как «князь, рождённый во вторник» или «господин вторника». Это типичная для казахской ономастики модель, где к имени дня недели добавляли социальный статус.

Словообразовательная модель фамилии проста и показательна для XIX–XX веков, когда у казахов, вошедших в состав Российской империи, начали массово фиксировать фамилии по русскому образцу. К основе Сейсембек прибавили суффикс -ов, образующий притяжательные фамилии («чей?» — Сейсембеков). Феминитив -а указывает на женскую линию или замужнюю женщину, но в бытовом употреблении фамилия Сейсембекова может принадлежать и мужчине, если это паспортная форма для женщины. Таким образом, фамилия буквально означает «принадлежащая к роду Сейсембека».

Географически фамилия Сейсембекова почти целиком привязана к Казахстану, особенно к южным и западным областям, где имя Сейсембек было особенно популярно. В России она встречается редко, в основном у потомков казахов, переехавших в соседние регионы. Социальный контекст: в дореволюционный период носители этой фамилии чаще всего были из среды скотоводов или мелкой знати (биев), поскольку «бек» в имени указывает на определённый статус. В советское время фамилия стала обычной, но сохранила связь с родоплеменной памятью: многие Сейсембековы до сих пор знают, к какому роду (жузу) принадлежат их предки.

Спорных версий происхождения немного. Иногда пытаются связать «Сейсем» с персидским «сейс» (три) или арабским «сис» (шесть), но это натяжки: в казахском языке закрепилось именно значение «вторник», подтверждённое и в других казахских именах, например Сейсенбай, Сейсенкул. Фамилия не имеет отношения к русским корням или славянским прозвищам — это чистый пример тюрко-русского синтеза в ономастике, когда местное имя получило русское оформление.