Фамилия Сезар — редкий случай, когда русская по форме фамилия имеет не славянские, а латинские корни. Она происходит от личного имени Цезарь (лат. Caesar), которое в русской традиции закрепилось в форме «Сезар» через западноевропейское посредничество. В отличие от привычных Иванов и Петров, эта фамилия не образована от крестильного имени напрямую, а скорее всего, возникла как прозвище или семинарская фамилия.

Словообразовательная модель здесь проста: основа «Сезар» плюс нулевой суффикс. Фамилия не имеет типичных русских суффиксов -ов, -ин, -ский, потому что она не прошла стадию отчества или притяжательного прилагательного. Такое возможно, если фамилия была дана в среде духовенства или записана в документах уже в готовом виде, без добавления родового суффикса. В русских говорах фамилии без суффиксов встречаются редко и часто указывают на позднее происхождение или иноязычное влияние.

Вероятнее всего, носитель фамилии Сезар — потомок семинариста или священника. В XVIII–XIX веках в духовных училищах было принято давать воспитанникам «благозвучные» фамилии по именам античных и библейских деятелей. Цезарь (Сезар) как имя римского императора и полководца был популярен среди семинаристов, стремившихся к эффектному звучанию. Альтернативная версия — фамилия могла закрепиться за выходцем из польских или украинских земель, где форма «Сезар» встречается как вариант имени Цезарь, но это менее вероятно из-за редкости фамилии.

В отличие от фамилий типа Цезарев или Цезарский, которые явно указывают на происхождение от отчества или места, фамилия Сезар стоит особняком. Она не даёт подсказки о регионе бытования: носители встречаются точечно, без выраженного ареала. Это типично для искусственных семинарских фамилий, которые не привязаны к географическому прозвищу или роду занятий предков. По сути, фамилия Сезар — это книжная метка, пережиток эпохи, когда духовенство выбирало себе фамилии по принципу «красиво и учёно», а не по отцу или деревне.