Фамилия Шафажо — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение напрямую связано с географией и историей миграций. Скорее всего, это не исконно русская, а западноевропейская фамилия, адаптированная кириллицей. Её основа — французское слово «chafage» или диалектное «chafaud», означающее «строительные леса», «помост» или «эшафот». В переносном смысле так могли прозвать плотника, строителя или человека, работавшего на возведении высоких конструкций.

Написание через «ж» и окончание «-о» указывает на то, что фамилия попала в русскую среду не напрямую из французского, а, вероятно, через польское или украинское посредничество. В польском языке, где заимствования из французского нередки, «szafaż» могло означать то же самое, а суффикс «-о» характерен для фамилий западноукраинского и белорусского происхождения (как, например, Шевченко, Ковальчук). Таким образом, предок носителя фамилии Шафажо мог быть переселенцем из Речи Посполитой, где получил прозвище по профессии.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с еврейским ашкеназским именованием. В идише существует слово «shafazh» (шафож) — искажённое от немецкого «Schaffhauser», то есть уроженец города Шаффхаузен в Швейцарии. В этом случае фамилия могла возникнуть как топонимическое прозвище у выходцев из этого региона, осевших в черте оседлости на территории современной Украины или Беларуси.

Словообразовательная модель фамилии проста: корень «шафаж-» и окончание «-о», которое в русском языке часто воспринимается как неизменяемое окончание фамилий украинского типа. Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Шафажо́, что также выдает её нерусское происхождение. Носители такой фамилии — редкость, и встретить их можно преимущественно на юго-западе России, в Краснодарском крае или Ростовской области, куда в XIX–XX веках переселялись крестьяне из Малороссии.