Фамилия Шафйдуров — редкий случай, когда написание подсказывает путь к разгадке. Буква «й» в середине слова сразу бросается в глаза: в русских фамилиях такая вставка нетипична. Скорее всего, перед нами русифицированная форма фамилии, исходное звучание которой было ближе к тюркскому «Шафидуров» или «Шафитдинов», где «й» возникла как графическая передача гортанного или мягкого звука.

Основа фамилии восходит к арабскому имени Шафи (Шафи‘) — «заступник», «исцеляющий», «ходатай». В исламской традиции это одно из имён, связанных с божественными атрибутами. К нему добавился персидский компонент «-дур» (или «-дир»), который в тюркских языках часто превращается в суффикс обладания, что-то вроде «имеющий свойство». Таким образом, Шафйдур — это «обладатель заступничества» или «тот, кто связан с Шафи». Суффикс «-ов» в конце — чисто русский, патронимический, он закрепился при адаптации фамилии в документах Российской империи.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически жили татары и башкиры: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская области. Встречается она и у казахов, но с другим окончанием — Шафидуров. Вариант с «й» чаще фиксируется у татар-мишарей и у тех, кто прошёл через канцелярскую запись в XIX веке, когда писари на слух фиксировали незнакомые звуки.

Род занятий предков по такой фамилии не угадать — она не ремесленная, а именная. Носители могли быть крестьянами, торговцами, муллами. Единственное, что можно сказать с уверенностью: фамилия указывает на мусульманское вероисповедание предков и их принадлежность к тюркскому или финно-угорскому (через татар) миру, принявшему ислам.

С точки зрения словообразования фамилия необычна: в ней смешались арабский корень, персидский аффикс и русский суффикс. Это типичный пример того, как в Поволжье и Приуралье складывались гибридные фамилии, не имеющие аналогов в чисто славянской среде.