Фамилия Шакланова — женская форма мужской фамилии Шакланов. Её основа, прозвище или мирское имя Шаклан, звучит необычно для современного уха, но имеет прозрачную этимологию, уходящую корнями в диалектную лексику.

Самое вероятное объяснение связывает слово «шаклан» с северными и сибирскими говорами, где так называли большую морскую птицу — баклана, а иногда и чайку-поморника. Прозвище Шаклан могли дать человеку за внешнее сходство с этой птицей (например, за крупный нос или длинную шею), за особый голос или за характер — крикливый, назойливый. В некоторых областях слово имело и переносное значение: «шакланом» дразнили высокого, нескладного парня. Менее распространённая версия возводит прозвище к тюркскому «шаклан» — «бешеный, буйный», что тоже не противоречит логике прозвищ, даваемых по поведению.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Шаклан добавили патронимический суффикс -ов, означающий принадлежность («чей?» — Шакланов сын). Суффикс -ов типичен для центральных и северных регионов России. Поскольку фамилия редкая, можно предположить, что родоначальник жил в Поморье, на Урале или в Сибири — в местах, где слово «шаклан» было в ходу. Встречается фамилия и в среде донских казаков, где подобные «птичьи» прозвища были обычны.

В отличие от фамилий на -ский, которые часто указывали на географическое название, Шакланов — чисто прозвищная фамилия. Её носитель — потомок человека, который в XVI–XVII веках получил яркое, может быть, нелестное, но запоминающееся уличное прозвище. Сословного барьера у фамилии не было: Шаклановы могли быть и крестьянами, и посадскими людьми, и казаками.