Фамилия Шалрупов — редкая и с трудом поддающаяся однозначному толкованию. Её основа «Шалруп» не встречается в современных словарях нарицательной лексики, что указывает на прозвищное происхождение. Скорее всего, перед нами диалектное или профессиональное прозвище, которое закрепилось за человеком и затем перешло в фамилию через стандартный русский патронимический суффикс -ов.

Наиболее вероятная версия связывает Шалрупа с глаголом «шалить» или существительным «шаль» (в значении «дурь, озорство»). Вторая часть — «руп» — могла быть диалектным вариантом слова «рупь» (рубль) или, что правдоподобнее, искажённым «храп» (храпеть, хрипеть). Тогда прозвище Шалруп могло означать «озорной рубль» (человек, легко тратящий деньги) или «шумный озорник» (от «шалить» + «храпеть»). Однако из-за редкости сочетания стоит допустить и вариант заимствования: в тюркских языках есть корень «шал» (седой, старый), а «руп» могло быть переосмыслением какого-то местного слова, но эта гипотеза остаётся слабой, так как не имеет прямых параллелей в фамилиях соседних народов.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: прозвище на согласный (Шалруп) плюс суффикс принадлежности -ов. Это указывает на то, что предок носителя фамилии был известен в своей общине именно под этим прозвищем, а его дети и внуки стали Шалруповыми. Суффикс -ов характерен для центральных и северных регионов России, но географию бытования фамилии определить сложно из-за её редкости. В официальных документах и переписях XVIII–XIX веков эта фамилия не фиксируется массово, что говорит о её локальном, возможно, даже однодворном происхождении.

В отличие от фамилий с прозрачной этимологией (Кузнецов, Попов), Шалрупов — пример того, как живая речь утратила слово, от которого образовано прозвище. Единственная деталь, которая может пролить свет, — это возможная связь с диалектным словом «шалрупа» (небрежный, неряшливый человек), зафиксированным в некоторых говорах Вологодской и Архангельской губерний. Если это так, то фамилия изначально носила характер насмешливого прозвища и относилась к человеку неаккуратному или безалаберному. В любом случае, носителям фамилии стоит искать корни в северных областях России, где диалектная лексика сохраняла подобные архаизмы дольше всего.