Фамилия Шамахтинский — редкий пример, когда географическое происхождение почти очевидно, но не даёт однозначного ответа. Основа фамилии — «Шамахт» — прямо указывает на город Шемаха (историческая Шамахы) в Азербайджане, бывшей столице Ширванского ханства. Однако суффикс «-инский» типичен для польской, украинской и, реже, русской дворянской ономастики. Это создаёт интригу: как человек с фамилией, звучащей по-польски или по-малороссийски, связан с кавказским топонимом?

Скорее всего, носитель фамилии — потомок выходца из Шемахи, который оказался в Речи Посполитой или на западе Российской империи. В XVII–XVIII веках купцы, ремесленники или пленные из Закавказья оседали в украинских и белорусских землях, и местное население давало им прозвища по месту прежнего жительства. Прозвище «Шамахтинец» (или «Шамахтинек») со временем оформилось в фамилию с типичным для тех краёв суффиксальным оформлением «-ский». Альтернативная версия — фамилия могла возникнуть у русского священника или дворянина, получившего приход или поместье с «экзотическим» названием, но это менее вероятно: топоним «Шамахта» в центральной России не встречается.

Морфологически фамилия прозрачна: корень «шамахт-» (от названия города), суффикс «-ин-» (указывает на принадлежность) и фамильный суффикс «-ский». Интересно, что в русском языке форма «Шамахтинский» вытеснила более естественное «Шемахинский» — сказалось влияние тюркского произношения (Şamaxı). Если бы предок звался просто «Шамахтиным», фамилия звучала бы иначе, но суффикс «-ский» выдаёт более высокий социальный статус: в XIX веке такие фамилии чаще носили мещане, духовенство и мелкопоместное дворянство, а не крестьяне.

Сведений о конкретных носителях фамилии в открытых источниках крайне мало — это не массовая фамилия, а штучная. Встречается она преимущественно на юге России и в восточной Украине, что косвенно подтверждает версию о миграции с Кавказа. Единственное, что можно сказать наверняка: предок Шамахтинских был человеком, для которого Шемаха была родиной или местом долгой жизни, а сама фамилия — редкий документ о перемещениях людей между Кавказом и славянскими землями.