Фамилия Шамхорская — редкий пример русской фамилии, образованной от географического названия с ярко выраженным нерусским корнем. Её основа — топоним Шамхор (или Шамхорка), который отсылает к реке Шамхор в Закавказье (современный Азербайджан) и к городу Шамкир, исторически известному как Шамхор. В царское время эта местность входила в состав Елисаветпольской губернии, и фамилия могла появиться у выходцев оттуда.

Суффикс -ск- указывает на типичную модель образования фамилий от названий местностей: Шамхор → Шамхорский → Шамхорская. Такие фамилии в основном носили дворяне (по владению землёй или по месту службы) и духовенство. Однако в случае с Шамхорской вероятнее, что фамилия принадлежала не столичному роду, а людям, переехавшим из закавказских регионов в центральную Россию, или же потомкам казаков, служивших на Кавказской линии. Встречается она крайне редко — в основном в южных областях России и на Кубани.

Женская форма Шамхорская, а не Шамхорова, говорит о том, что фамилия закрепилась в роду через мужчину, которого звали Шамхорским. В документах XIX века фамилия могла писаться через «а» — Шамхарская, под влиянием местного произношения. Путаница с буквой «о» и «а» в первом слоге — типичная ошибка при переписи, которая не меняет корня.

Поскольку фамилия штучная, её носители, скорее всего, не были многочисленными помещиками. Скорее это потомки мелких чиновников, офицеров или священников, служивших в Закавказье. Однокоренных фамилий в русском языке почти нет, что делает Шамхорскую ярким маркером миграции или военной карьеры предка на южных рубежах империи.