Фамилия Шамяунов — редкий пример, в котором необычная форма не скрывает, а, наоборот, проясняет историю. Если отбросить суффикс -ов, остаётся основа Шамяун. Такое окончание -ун характерно для русских прозвищ, образованных от глаголов: говорун, ворчун, крикун. Значит, Шамяун — это прозвище человека, который «шамял», то есть что-то делал с характерным звуком или особенным образом.

Глагол «шамять» или «шамать» в русских говорах означает «жевать», «чавкать», а иногда и «есть вообще» (сравните с диалектным «шамкать» — говорить невнятно, как беззубый). Таким образом, Шамяунов — потомок человека, которого прозвали за манеру есть (возможно, неторопливо, с причмокиванием) или за неразборчивую, «шамкающую» речь. Прозвища по физиологическим особенностям — один из древнейших пластов русских фамилий, и здесь мы видим именно такой случай.

Модель образования проста: к прозвищу на -ун добавили типичный русский суффикс -ов, означающий принадлежность («чей?» — Шамяунов). Фамилия явно недворянская, не искусственная — она выросла из бытового прозвища в крестьянской или мещанской среде. Географически корни, скорее всего, лежат в северных или центральных русских говорах, где слово «шамять» фиксируется диалектологами.

Встречается и вариант Шамякин, но Шамяунов сохранил более редкую и архаичную суффиксальную форму. Фамилия не имеет отношения к тюркским или кавказским языкам, хотя на слух может показаться инородной — это чисто русское прозвищное образование, которое со временем закрепилось как фамильное имя.