Фамилия Шанбахер образована от аналогичного прозвища, восходящего к топониму Шанбах (Schanbach). Так называется город, расположенный близ Штутгарта. Компонент –ер является суффиксом принадлежности, который часто используется при образовании немецких фамилий. Так могли назвать выходца из Шанбаха и его окрестностей.