Фамилия Шаниметов — редкий случай, когда разбор начинается не с корня, а с суффикса. Перед нами типичная тюркская модель на -ет, которая в русской среде обросла окончанием -ов. Если убрать русский патронимический суффикс, останется основа Шанимет. Это не что иное, как имя Шанимет, образованное по той же схеме, что и многие казахские, киргизские или каракалпакские имена: к арабскому имени Шани (شاني — «восхваляющий», «прославляющий») добавили компонент -мет. В тюркских языках «мет» или «бет» означает «лицо», «лик», но в именах часто выступает как усилительная частица, придающая значение «самый», «настоящий». Таким образом, Шанимет можно перевести как «истинно восхваляющий» или «тот, чей лик прославляет».

Вероятнее всего, фамилия происходит от личного имени Шанимет, которое бытовало у народов Средней Азии и Южного Казахстана. В русскую документацию это имя попало через перепись или метрические записи, где его записали как Шаниметов, то есть «сын Шанимета». Обратите внимание на суффикс -ет: в отличие от более частых тюркских фамилий на -бай или -бек, окончание -мет указывает на более древний пласт имен, связанных с религиозной или социальной характеристикой человека.

Географически фамилия тяготеет к южным областям Казахстана и Киргизии, а также к Ташкентской области Узбекистана. В России она встречается крайне редко, в основном у потомков переселенцев из этих регионов. Социально носители фамилии могли происходить из среды кочевников-скотоводов или оседлых земледельцев — имя Шанимет не несло сословной окраски, оно было распространено среди простого народа, хотя и подчеркивало благочестие семьи.

Стоит упомянуть альтернативную версию, по которой Шанимет — это искаженное персидское «шах немет» («царская милость»), но она менее правдоподобна: в тюркских языках «немет» редко переходит в «нимет», а компонент «шани» в данном корпусе имен встречается именно как арабское имя, а не часть титула. Так что основная версия — арабо-тюркское сложение с яркой религиозной окраской.