Фамилия Шанодин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа «Шанод» не встречается ни в крестильных святцах, ни в распространённых прозвищных словарях. Это значит, что перед нами либо местное диалектное слово, либо искажённое имя или прозвище, записанное на слух.

Самый вероятный путь — отчество от прозвища или имени Шанода. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Шанодин, то есть сын Шаноды. Что могло значить само слово «Шанода»? Можно предположить связь с диалектным глаголом «шанать» — в некоторых северных и сибирских говорах это означало «шарить, рыться, искать ощупью». Тогда Шанодой могли прозвать неловкого или суетливого человека, который всё время что-то ищет. Однако эта версия остаётся гипотетической, так как глагол малоупотребителен, а фамилия почти не встречается в центральных областях.

Другая, более правдоподобная гипотеза — фонетическое искажение. Фамилия могла возникнуть из тюркского имени или прозвища, например, от «Шан» (слава, известность) с добавлением уменьшительного суффикса -од, характерного для некоторых тюркских диалектов. В русской среде такое имя могли переоформить по модели отчества на -ин. В пользу этой версии говорит то, что фамилии с элементом «Шан» (Шанин, Шанов) встречаются в Поволжье и на Урале, где были сильны тюркские влияния. Шанодин — более редкий вариант, но словообразовательно он вписывается в эту группу.

Третья возможность — происхождение от географического названия. В России есть несколько мелких речек и урочищ с корнем «Шан-» (например, Шаньга, Шанда). Житель такого места мог получить прозвище Шанода, а его потомки — фамилию Шанодины. Но без точной привязки к конкретной местности это лишь догадка.

По сословному составу ничего определённого сказать нельзя: фамилия настолько редка, что её носители могли быть и крестьянами, и мещанами, и духовенством. В дореволюционных метрических книгах она почти не фиксируется, что указывает на локальное бытование, возможно, в одной-двух деревнях. Сегодня Шанодины встречаются в основном в Сибири и на Дальнем Востоке, что косвенно подтверждает версию о переселении носителей фамилии в ходе аграрных реформ или ссылки.