Фамилия Шапоншикова образована от прозвища или профессии предка — мастера по изготовлению шляп. В основе лежит слово «шапон», диалектный вариант общеизвестного «шапка» или «шляпа». В русских говорах, особенно на юге и западе, «шапоном» называли головной убор, а «шапонщиком» — того, кто его шил или продавал. Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, был ремесленником-шапочником, владельцем шляпной мастерской или торговцем.

С точки зрения словообразования, фамилия прошла несколько этапов. Сначала к основе «шапон» добавили суффикс -щик-, указывающий на род занятий (как «каменщик» или «шарманщик»). Затем от «Шапонщик» образовали притяжательное прилагательное с суффиксом -ов: Шапонщиков, то есть «сын шапонщика». А финальное -а — это окончание женского рода, указывающее, что перед нами форма, закреплённая за женщиной. В русской традиции фамилии на -ов/-ев склоняются, и Шапоншикова — это именно женский вариант; мужской звучит как Шапоншиков.

Фамилия редкая и встречается преимущественно в центральных и южных областях России, а также среди потомков переселенцев на Урал и в Сибирь. Встречаются варианты написания с одной «ш» — Шапошикова, что может быть следствием упрощения при произношении или ошибкой писаря. Интересно, что корень «шапон» родствен слову «шапка», но в литературном языке закрепился именно суффикс -к-, а диалектный «шапон» — более архаичная форма, родственная польскому «czapka» и чешскому «čepice».

В отличие от более частых Шаповаловых (от «шаповал» — мастер, валявший шляпы из шерсти) или Шапочниковых, фамилия Шапоншикова сохранила редкую диалектную основу. Это указывает на то, что предки носительницы фамилии жили в местности, где говор сохранял старые черты, и занимались конкретным ремеслом — не валянием, а именно шитьём или торговлей шляпами.