Фамилия Шатпакова образована от тюркского прозвища, в основе которого лежит слово «шатпак» или близкие к нему диалектные формы. В казахском и других тюркских языках «шатпак» означает «сорняк», «бурьян», «колючая трава». Прозвище Шатпак могли дать человеку за внешнее сходство с таким растением — например, за жесткие, торчащие волосы, неопрятность или колкий, неуживчивый характер. В переносном смысле слово могло означать и «задира», «ершистый человек».

Фамилия имеет женскую форму на -а, что характерно для русской и некоторых других славянских традиций фиксации фамилий. Мужской вариант — Шатпаков. По модели образования фамилия относится к типичным русским фамилиям с суффиксом -ов/-ев, которые массово возникали в XIX веке при оформлении документов у народов, входивших в состав Российской империи. Суффикс указывает на принадлежность: «сын или потомок Шатпака».

Географически фамилия чаще всего встречается среди казахов, а также у татар и башкир. Встречается и в среде метисного населения приграничных областей. В дореволюционных переписях эта фамилия могла фиксироваться с разным написанием: Шатпаков, Шатпакулы, Чаптаков — из-за вариативности передачи тюркских звуков кириллицей.

В словаре тюркских фамилий, составленном по материалам XIX века, основа «шатпак» нередко связывается и с названием местности — оврага или заросшего бурьяном участка. Вероятно, прозвище могло закрепиться за человеком, жившим в такой местности или владевшим таким участком. Социально фамилия не указывает на знатное происхождение — она характерна для крестьян, ремесленников и скотоводов.

Сегодня фамилия Шатпакова остаётся сравнительно редкой, что делает её носителей легко идентифицируемыми в поисковых системах и генеалогических базах.