Фамилия Шавгунова — женская форма фамилии Шавгунов, и её происхождение связано с прозвищем, которое, скорее всего, имело тюркские корни. Основа «шавгун» (или «шавган») восходит к тюркскому слову, означающему «крик», «шум», «гам» или «суматоха». В некоторых тюркских языках, например, в казахском или татарском, «шавган» — это не просто шум, а нечто вроде «переполоха» или «суеты». Таким образом, Шавгуном в русской среде могли прозвать человека шумного, крикливого, суетливого или, наоборот, того, кто постоянно оказывался в центре скандалов и беспорядков.

Словообразовательная модель фамилии проста: суффикс -ов (-ев) присоединился к прозвищу Шавгун, образовав типичную русскую фамилию-притяжательное прилагательное («чей?» — Шавгунов). Женская форма Шавгунова означает «дочь или жена Шавгунова». Фамилия встречается в основном на юге России и в Поволжье — регионах, где исторически было сильное влияние тюркских языков и культур. Это не случайно: прозвища на «-гун» в русских фамилиях часто указывают на тюркское происхождение (сравните с фамилиями Шамгунов, Тугунов, Балгунов).

Встречается и альтернативная, менее вероятная версия: связь с арабским словом «шавган» (родственник, свойственник) или с персидским «шавган» (пастух, пасущий скот). Однако в русском ономастическом контексте первая версия — от «шума и крика» — выглядит правдоподобнее, так как прозвища по характеру или поведению были очень распространены. Фамилия Шавгунова не относится к дворянским или знатным родам — это типичная крестьянская или мещанская фамилия, образованная от бытового прозвища. Её носители, скорее всего, были простыми людьми, чью особенность — громкий голос или живой нрав — закрепили в родовом имени.