Фамилия Шайхатуллин — типичный пример того, как русская словообразовательная модель наложилась на арабско-тюркское имя. Корень здесь — сложное мужское имя Шайхатулла, которое состоит из двух частей: «шайх» (араб. «старейшина», «предводитель», а в религиозном контексте — «наставник», «знаток ислама») и «улла» (форма арабского «Аллах»). В сумме имя означает «старейшина Аллаха» или «наставник от Аллаха», что звучит как высокая духовная характеристика. Русский суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — сын или потомок Шайхатуллы.

Этот тип фамилий характерен для татар, башкир и других тюрко-мусульманских народов Поволжья и Приуралья, которые в XIX — начале XX века массово получали русские фамилии путём добавления -ов или -ин к отцовскому имени. Форма на -ин, а не на -ов, встречается реже и обычно указывает на основу, оканчивающуюся на гласный или мягкий согласный. В данном случае имя Шайхатулла заканчивается на «а», поэтому и возник Шайхатуллин, а не Шайхатуллов.

Географически фамилия распространена в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — регионах традиционного проживания татар и башкир. Встречается и среди казахов, но там чаще используют форму Шайхатуллаев. В дореволюционных метрических книгах можно найти варианты написания — Шайхатулин, Шайхатуллин, а иногда и Шайхатулла. Двойное «л» в середине (Шайхатуллин) — результат адаптации арабской удвоенной согласной, которая в тюркских языках обычно сохраняется.

Социальный контекст: предки носителя фамилии, скорее всего, были связаны с духовенством или уважаемыми общинными лидерами. Имя Шайхатулла давали в семьях, где ценили религиозное образование и авторитет, поэтому среди Шайхатуллиных нередко встречались муллы, учителя медресе или просто грамотные люди, записанные в сословие государственных крестьян или мещан. Дворянского происхождения у этой фамилии нет — это фамилия духовного сословия и крестьян-мусульман.