Фамилия Щахмедова — редкая и с первого взгляда неочевидная для русского уха. Её основа явно не славянская, и чтобы разобраться в происхождении, нужно смотреть в сторону тюркских или иранских языков, а также учитывать особенности передачи восточных имён в русской письменности.

Скорее всего, в основе фамилии лежит имя или прозвище Щахмед. Это, в свою очередь, может быть искажённой или диалектной формой от имени Шахмед. Первая часть — «шах» (персидское «царь, владыка»), вторая — «мед» (от арабского «Мухаммад» — «восхваляемый»). Таким образом, Шахмед — это «царь Мухаммад» или «владыка, достойный хвалы». Имя было распространено среди народов Кавказа и Поволжья, особенно в азербайджанской, дагестанской и татарской среде. Фонетический переход «ш» в «щ» в русских документах — характерная черта: так чиновники на слух записывали непривычные шипящие звуки.

Суффикс «-ов» в окончании указывает на русскую модель образования фамилий по принципу принадлежности. Щахмедова — «дочь (или жена) Щахмеда». Первоначально это было отчество, которое закрепилось за родом. Фамилия могла возникнуть в среде крещёных татар или горских народов, перешедших в православие, либо, что реже, у мусульман, чьи имена в XIX веке при переписях русифицировали.

Географически фамилия тяготеет к югу России: Дагестан, Чечня, Астраханская область, а также к татарским регионам. Встречается она крайне редко, что делает её носителей носителями уникального антропонима, который хранит память о сложных этнических и языковых контактах на границе Европы и Азии. Есть и менее вероятная версия: связь с арабским словом «шахид» (святой, павший за веру), но в таком случае форма была бы иной — Шахидов. Поэтому версия с именем Шахмед остаётся основной.