Фамилия Щайдуллина явно указывает на тюркское, скорее всего татарское или башкирское происхождение. Её основа — мужское имя Щайдулла, которое представляет собой адаптированную в русском языке форму арабского имени Шайдулла (или Шайхулла). В переводе с арабского оно означает «старец Аллаха» или «божий старец», где «шайх» — почтенный, старейшина, религиозный авторитет. Таким образом, имя давалось в честь уважаемого, набожного человека, возможно, духовного наставника.

Фамилия образована по стандартной русской модели добавлением суффикса -ин к основе имени: Щайдулл(а) + ин = Щайдуллин. Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность («чей?»), то есть Щайдуллин — «сын Щайдуллы» или «из рода Щайдуллы». Женская форма Щайдуллина — это грамматическое изменение по роду, характерное для русской фамильной системы у тюркских народов, проживающих на территории России.

Интересная особенность этой фамилии — написание через букву «Щ». В исконном тюркском произношении имя звучит как «Шайдулла» (с мягким «ш»), но при записи в русских документах, особенно в XIX — начале XX века, часто происходила замена «Ш» на «Щ» из-за особенностей регионального произношения или канцелярской ошибки. Встречаются и другие варианты: Шайдуллин, Шайдуллаев. Фамилия Щайдуллина — это живое свидетельство того, как фонетика конкретного говора или почерк писаря могли закрепиться в официальном родовом имени.

Географически фамилия распространена в регионах с компактным проживанием татар и башкир: в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской, Челябинской, Самарской областях. Носители фамилии, скорее всего, потомки крестьян или сельских жителей, так как основная масса тюркского населения в Российской империи относилась к податным сословиям, и фамилии у них закрепились поздно — к концу XIX века, при переписях. Фамилия не указывает на дворянское происхождение, но прочно связана с историей и культурой волго-уральских татар.