Фамилия Щублиньска — редкий случай, когда написание выдаёт в ней почти наверняка женщину. Форма на -а, а не на -ий/-ый, указывает на женский род: это не исходная фамилия, а её вариант, который в польской традиции носят незамужние дочери (Щублиньска) и замужние женщины (Щублиньска). В русской среде такая фамилия могла закрепиться уже в женском обличье, без переделки на мужской лад, что бывает у потомков польских дворянок или переселенок.

Основа фамилии — «Щубль» или «Щубля». Скорее всего, это вариант прозвища от польского «szczubiel» — «щегол» или, в переносном смысле, «франт, щёголь». В говорах встречается и «щубель» — «небольшая щепка, лучина», но для фамилии вероятнее первое: прозвище могли дать человеку яркому, нарядному, любящему прихорашиваться. Суффикс -иньск- (-iński) — типично польский, указывает на происхождение из населённого пункта с корнем Щубл- (например, Щублин). Такие фамилии образовывали по модели «откуда родом»: Щублиньский — тот, кто из Щублина или Щублева.

Географически фамилия тяготеет к восточной Польше и бывшим землям Речи Посполитой — Западной Украине, Беларуси, Литве. Встречается и в современной Польше, но нечасто. В России и Украине носители — в основном потомки шляхты, которые после разделов Польши оказались в составе Российской империи и сохранили фамилию в польском написании.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Щубель, Щуба, Щубов — показывает, что Щублиньска стоит особняком: это не просто прозвище, а указание на место или принадлежность к роду, владевшему землёй в Щублине. Если предки были шляхтичами, то фамилия могла попасть в гербовники. Если крестьянами — то в метрики костёлов. Точных данных о сословии нет, но сама модель на -иньск- в польской ономастике чаще встречается у дворян, чем у простых людей.