Фамилия Шебалкин образована от прозвища Шебалка. Диалектным словом «шебала» (или «шабала») в рязанских и тамбовских говорах означают лохмотья, ветошь, истасканную одежду, а в пермских и костромских – всякую деревянную посуду. Таким образом, Шебалкой могли называть нищего человека или же мастера по изготовлению посуды. В то же время в южных областях прозвище Шебалка нередко закреплялось за болтуном, а также праздным человеком. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шебалка, со временем получил фамилию Шебалкин.