Фамилия Шекатуров — редкий случай, когда разбор упирается не столько в основу, сколько в суффикс. В ней отчетливо видна модель «прозвище + -ур(а) + -ов», что сразу выдает фамилию, образованную от прозвища на -ура, -ур. В русской ономастике такие формы — Шекатура, Шекатур — нередко давали людям с яркой, часто ироничной характеристикой: суффикс мог передавать грубоватость, просторечность или принадлежность к определенной среде.

Сама основа «шекат-» спорна. Самое прямое объяснение — от диалектного глагола «шекать» (ударять, бить, щёлкать) или существительного «шёкот» (треск, щелчок). В таком случае Шекатурой могли прозвать человека, который чем-то постоянно стучал, щёлкал, издавал резкие звуки — например, плотника, кузнеца или просто суетливого, резкого в движениях человека. Менее вероятно, но возможно, что в основе лежит тюркское «шекер» (сахар) — тогда прозвище могло относиться к сладкоежке или торговцу сладостями, но фонетический переход «р» в «т» маловероятен для русских говоров, поэтому эта версия слабая.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и поволжским областям, где суффикс -ур(а) в прозвищах встречался чаще. Встречаются единичные записи в Курской, Тамбовской и Саратовской губерниях. В современных справочниках фамилия малочисленна, что указывает на её позднее оформление и, вероятно, однократное возникновение в конкретной крестьянской или ремесленной среде.

Если смотреть на словообразовательный ряд, то Шекатуров стоит в одном ряду с фамилиями вроде Чикатуров (от «чикать» — ударять, сечь) или Щелкунов (от «щелкун»). Все они описывают человека по характерному звуку или действию. Таким образом, предок носителя фамилии, скорее всего, получил прозвище за манеру стучать, щёлкать или работать с резкими, отрывистыми движениями — будь то в кузне, в плотницком деле или в быту.