Прозвище Шекмар является фонетическим вариантом прозвища Чекмарь. Прозвище Чекмарь, в свою очередь, восходит к нарицательному «чекмарь», значение которого В.И. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет следующим образом: «колотушка, деревянный молот», а также «кожаная, свернутая и прошитая концом насквозь пуговица». Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Чекмарь относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог заниматься изготовлением деревянной утвари или же пуговиц. Согласно другой гипотезе, в основе фамилии Шекмар лежит имя Шекмар, диалектный вариант тюркского мужского имени Шаймардан, которое в переводе с персидского означает «повелитель сильных и смелых мужчин».