Фамилия Шепоренко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках стала доминирующей на Левобережной Украине и в Слобожанщине. Суффикс -енко изначально имел значение «маленький» или «сын» (как уменьшительно-патронимический), то есть Шепоренко — это буквально «сын Шепора» или «маленький Шепор». Со временем эта модель закрепилась как наследственная фамилия, а не отчество, и стала указывать на принадлежность к определённому роду.

Основа фамилии — прозвище Шепор. Его происхождение спорно, но наиболее вероятна связь с диалектным украинским словом «шепір» (или «шепора»), которое в некоторых говорах означало «щепка», «заноза», «колючка». Прозвище Шепор могли дать человеку худощавому, острому на язык или, наоборот, колючему по характеру. Другая версия отсылает к глаголу «шепотіти» (шептать), но это менее убедительно: звуковой переход «т» в «р» нехарактерен для восточнославянских языков. В белорусском и польском языках есть слово «szepior» (старая метла, веник), что также могло стать прозвищем неряшливого или суетливого человека.

Географически фамилия Шепоренко тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Полтавщине, Черкасщине, Сумщине. Встречается она и в южных регионах России, куда переселялись украинские крестьяне в XIX веке. Сословно носители фамилии относились к казачеству и крестьянству: в ревизских сказках и исповедных ведомостях XVIII–XIX веков Шепоренки числятся в основном как «малороссийские казаки» и «казённые крестьяне». Дворянской ветви у фамилии не зафиксировано, что типично для патронимов на -енко, которые редко попадали в гербовники. Интересно, что ударение в фамилии плавающее: часть носителей произносит Шепоре́нко, часть — Шепоренко́, что отражает разную степень огласовки суффикса в местных говорах.