Фамилия Шепыкина — женская форма фамилии Шепыкин, которая образована от прозвища или мирского имени Шепыка. В основе лежит древнерусское слово «шепа» — так в ряде говоров называли щепку, занозу, а также худого, тщедушного человека. Сравните с диалектным «шепелявый» (шепелявый, нечисто выговаривающий слова) или «шепотник» (наушник, сплетник). Таким образом, Шепыкой могли прозвать либо человека невысокого роста и хрупкого телосложения, либо того, кто говорил невнятно, шепелявил.

Модель образования типична для русских фамилий: к основе на -а прибавляется патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность потомку. Шепыкин — буквально «сын Шепыки», то есть потомок того самого Шепыки. Суффикс -ин в этой фамилии закономерен: по правилам русской грамматики он присоединяется к основам, оканчивающимся на -а или -я.

Географически фамилия Шепыкин встречается нечасто, но имеет выраженную привязку к северным и центральным областям России, особенно к Вологодчине и Архангельской губернии. В ономастических словарях она не относится к числу широко распространённых, что говорит о локальном происхождении прозвища. Вероятно, родоначальник жил в одном из сёл или деревень Русского Севера, где и получил своё прозвище, позже ставшее фамилией.

Редкость фамилии в том, что она сохранила старую диалектную основу, почти исчезнувшую из современного языка. В отличие от более частых «Щепкиных» (от «щепка»), «Шепыкины» закрепили именно северный вариант произношения — с «ы» вместо «е» и без смягчения. Это делает фамилию ценным свидетельством живых говоров прошлого: по ней можно восстановить, как звучало слово в конкретной местности несколько веков назад.