Фамилия Шетохин — одна из тех, где внешне понятная основа скрывает сразу несколько возможных объяснений, и выбрать единственное не всегда просто. На первый взгляд, в ней выделяется корень «шетох-» и типичный русский фамильный суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей?» — Шетохи. Такая модель характерна для фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а, -я.

Самый прямой путь — прозвище Шетох. В русских говорах слово «шетох» или близкое к нему «шеток» могло означать нечто шероховатое, неровное, возможно, связанное с обработкой дерева или ткани. Например, в некоторых диалектах «шетох» — это заноза, щепка, или же человек с грубой, «шелушащейся» кожей. Тогда Шетохин — потомок человека, которого прозвали за внешность или профессию, связанную с древесиной.

Вторая версия уводит в сторону тюркских языков. Основа «шет» (шесть) в сочетании с «ох» (стрела) или «ок» (род, племя) могла дать прозвище в среде татарских или башкирских родов. Но это менее вероятно: фамилия Шетохин не фиксируется как распространённая в тюркоязычных регионах, а её типично русский суффикс -ин говорит о том, что она, скорее всего, оформилась уже на русской почве.

Есть и третья, более прозаичная гипотеза: Шетохин — вариант фамилии Шетохин от имени Шетох, которое могло быть уменьшительной формой от крестильного имени, например, от Феодосий или Федот. В народной речи «Федоха» легко превращалось в «Шетоха» через ассимиляцию звуков. Такое объяснение поддерживается тем, что фамилия встречается в центральных и южных областях России, где подобные фонетические переходы не редкость.

Географически фамилия Шетохин редкая. Больше всего её носителей зафиксировано в Воронежской и Липецкой областях, что косвенно подтверждает связь с южнорусскими говорами. Сословно предки могли быть как крестьянами, так и однодворцами — эта группа часто сохраняла старые прозвищные фамилии. Точных данных о дворянском происхождении нет.

Таким образом, наиболее вероятно, что Шетохин — потомок человека по прозвищу Шетох, которое либо описывало внешнюю особенность, либо произошло от разговорной формы христианского имени. Фамилия несёт в себе следы народной фонетики и региональных говоров.