Фамилия Шейднерук — редкий случай, когда в одной основе сплелись немецкий корень и восточнославянский суффикс. Она образована по типичной для украинской и белорусской ономастики модели: к прозвищу или имени прибавили уменьшительный суффикс -ук (варианты -чук, -юк), который указывал на сына, ученика или молодого человека. В данном случае исходная форма — Шейднер, а «руком» в конце — не «рука», а искажение немецкой фамилии при адаптации в славянской среде.

Корень восходит к немецкому «Scheidner» — производному от глагола «scheiden» (разделять, различать, разводить). В немецком языке так называли судью, разбирающего тяжбы, или человека, который занимался размежеванием земель. Есть и вторая версия: в южнонемецких диалектах «Scheidner» — это лесник или объездчик, который следил за границами лесных угодий. Оба занятия были востребованы в немецких колониях, которые в XVIII-XIX веках массово основывали на Волыни, в Подолье и в Галиции.

Носители фамилии Шейднерук, скорее всего, потомки немецких колонистов, переселившихся на территорию современной Западной Украины и Беларуси. Местное население, не привыкшее к немецким фамилиям, переделало «Шейднер» на свой лад, добавив типичный для этих мест суффикс -ук. Так сын Шейднера стал Шейднеруком, а сама фамилия закрепилась в украинских и белорусских метриках.

Сегодня фамилия встречается крайне редко, преимущественно в Волынской, Ровенской и Тернопольской областях Украины, а также среди потомков переселенцев в западных регионах России. Написание с «е» после «й» (Шейднерук, а не Шайднерук) указывает на немецкое произношение, где дифтонг «ei» читается как «ай». Но в русской и украинской передаче закрепился вариант через «е» — так фамилия звучит мягче и привычнее для славянского уха.