Фамилия Шейхумерова — женская форма фамилии Шейхумеров, и её происхождение напрямую связано с мусульманским миром и тюркскими языками. В основе лежит составное имя или прозвище, где первая часть «шейх» (от арабского — старейшина, духовный наставник, глава рода или религиозной общины) указывает на высокий социальный или религиозный статус предка. Вторая часть — «умер» — это вариант арабского имени Умар (в русской транскрипции часто передаётся как Омар), что значит «жизнь», «живущий». Таким образом, буквальное значение фамилии — «принадлежащий Шейх-Умару», то есть потомок человека, которого звали или почтительно называли «шейх Умар».

Модель образования типична для многих фамилий народов Северного Кавказа, Поволжья и Средней Азии. Суффикс «-ов/-ев» (в женском роде «-ова») указывает на принадлежность к роду, на русский манер оформляя тюркскую или арабскую основу. Встречаются варианты написания с одной «м» — Шейхумерова, что связано с особенностями произношения и записи фамилий в документах XIX–XX веков.

Географически фамилия Шейхумерова распространена среди татар, башкир, а также у народов Дагестана, где титул «шейх» имел особое значение в суфийских братствах. Вероятнее всего, родоначальник был либо религиозным деятелем (муллой, шейхом), либо уважаемым старейшиной, чьё имя или прозвище со временем закрепилось за его детьми и внуками. В отличие от многих русских фамилий, образованных от крестильных имён, эта фамилия напрямую отражает исламскую традицию и социальную иерархию в общине.

С точки зрения ономастики, фамилия Шейхумерова — пример того, как арабская лексика через тюркское посредничество вошла в фамильную систему народов России. В словарях тюркских фамилий подобные конструкции (Шейх- + имя) встречаются нечасто, что делает эту фамилию не только звучной, но и достаточно редкой по словообразовательной модели.