Фамилия Шейшеналиев — одна из тех, что сразу выдают своё происхождение: это мусульманская фамилия, образованная по тюркской модели с арабской основой. Если разобрать её по частям, то корень здесь — личное имя Шейшен, которое, скорее всего, восходит к арабскому «шайшан» (шайтан, дьявол, злой дух). Звучит неожиданно, но в мусульманской ономастике такие имена-обереги встречаются: родители могли назвать сына Шейшеном, чтобы отогнать злые силы или, наоборот, «приручить» их, сделав имя защитным. Вторая часть — «али» — это арабское имя Али (высокий, возвышенный), одно из самых распространённых в исламском мире, а суффикс «-ев» (часто в форме «-иев») — русский патронимический, типичный для фамилий, которые оформляли в Российской империи для нерусских народов. Таким образом, Шейшеналиев — это «сын Шейшена Али», то есть человека, которого звали Шейшен, а его отца — Али.

Фамилия явно тюркского происхождения, и её география — регионы, где сильно влияние ислама и тюркских языков: Кыргызстан, Казахстан, юг Узбекистана, возможно, Татарстан. В русских архивах она редка, но встречается в списках переселенцев или потомков кочевников. Интересно, что имя Шейшен не является каноническим мусульманским (в Коране его нет), а скорее народным, диалектным — это указывает на то, что предки носителя фамилии жили в среде, где арабские имена адаптировались под местное произношение и бытовую магию.

В написании фамилии есть нюанс: в разных записях она может выглядеть как Шейшеналиев, Шейшеналиев, а иногда и Шейшенали у народов, где фамилии ещё не русифицировали. Суффикс «-ев» (а не, скажем, «-улы» или «-оглы») указывает на то, что фамилия оформлялась в период активной русификации XIX — начала XX века, когда кочевников приписывали к оседлым сословиям и давали им фамилии по отцу. Так что предки Шейшеналиева могли быть скотоводами, торговцами или ремесленниками в одном из среднеазиатских ханств или Российской империи.

Что касается социального статуса: ничего не известно о дворянском или купеческом происхождении — фамилия слишком редкая и не фигурирует в родословных книгах. Скорее всего, это фамилия крестьянская или ремесленная, но не бедная: наличие двойного имени (Шейшен-Али) говорит о том, что предок был заметным человеком в своей общине, возможно, муллой или аксакалом. Если искать аналоги, то можно вспомнить фамилии вроде Алиев, Шейхов, но Шейшеналиев уникален тем, что сохранил редкое имя-оберег.