Фамилия Шездюкова — редкий случай, когда географическая привязка оказывается важнее морфологического разбора. Её основа, Шездюк, почти наверняка указывает на выходца из западных регионов бывшей Речи Посполитой, где фамилии на -юк особенно характерны для украинского Полесья и Волыни. Суффикс -юк — типичный патронимический (сын кого-то), то есть в основе лежит личное имя или прозвище.

Вероятнее всего, корень «Шезд-» — это искажённое или диалектное произношение имени Шестак (шестой ребёнок в семье) либо Шиш (прозвище по внешности или характеру). В польском и западноукраинском говорах звук [ш] мог перейти в [ш] с палатализацией, а «-д-» возникло как протетический согласный для удобства произношения: Шестюк → Шездюк. Менее вероятна связь с литовским šeštas (шестой) — фамилия могла возникнуть на этнически смешанных землях Беларуси и Литвы.

Женская форма на -а — Шездюкова — показывает, что носительница либо замужем за Шездюковым, либо является дочерью Шездюка. В русской традиции фамилии на -ов/-ев образуются от прозвищ на твёрдый согласный, что подтверждает: исходная мужская форма была Шездюк, а не Шездюко (последнее характерно для украинской модели на -о).

Сословно фамилия не привязана к дворянству или духовенству — скорее к крестьянской или мещанской среде. В дореволюционных переписях Шездюковы встречаются единично, преимущественно в юго-западных губерниях Российской империи (Волынская, Подольская, Киевская). После массовых переселений XIX–XX веков фамилия могла расселиться по Сибири и Дальнему Востоку, но до сих пор остаётся очень редкой — в современных телефонных справочниках России её носителей не наберётся и трёх десятков.

Единственная правдоподобная версия происхождения: предок носителя был «шестым сыном» (от Шестак), а фамилия закрепилась в западноукраинском говоре с характерной фонетической перестройкой. Альтернативные гипотезы (от тюркских или финно-угорских корней) не находят подтверждения — ни один известный словарь фамилий не фиксирует подобного варианта.