Фамилия Шилибольский происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Шилибольский образована от названия алтайской реки Шелаболиха. Возможно, оно ведет свое начало от двух турецких слов: şile – «душица» и bol – «широкий, свободный». В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Шилибольский, со временем получил фамилию Шилибольский. О точном месте и времени возникновения фамилии Шилибольский в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Шилибольский представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.