Фамилия Шинкаенко — яркий пример украинской фамилии, образованной по прозвищу, связанному с ремеслом. В её основе лежит слово «шинкарь» — владелец шинка, то есть небольшого питейного заведения, трактира или корчмы. На юго-западе Российской империи, особенно на территории современной Украины и Беларуси, шинкари были заметными фигурами в сельской и местечковой жизни: они не только торговали спиртным, но часто служили посредниками, скупщиками или просто держали «центр притяжения» для местных жителей. Прозвище Шинкарь (или его варианты Шинка, Шинкар) давали либо самому содержателю шинка, либо, что нередко, его работнику или человеку, который часто там бывал.

Словообразовательная модель здесь — классическая для украинских фамилий на -енко. Суффикс -енко имеет значение «маленький», «сын» или «потомок». Таким образом, Шинкаенко — это буквально «сын Шинкаря» или «потомок того, кто держал шинок». Эта модель была особенно продуктивна в XVII–XVIII веках на Левобережной и Слободской Украине, где фамилии на -енко стали маркером казацкой старшины и мещан, но со временем распространились на все сословия. Интересно, что фамилия Шинкаенко встречается реже, чем, скажем, Шинкаренко или Шинкарёв, что может указывать на более локальное бытование — возможно, в определённом регионе, где закрепился именно такой вариант произношения прозвища.

В отличие от фамилий, образованных от имён или профессий с суффиксом -ов/-ев, фамилия Шинкаенко не содержит указания на принадлежность конкретному хозяину (как в русской модели). Она подчёркивает родство по мужской линии и социальную роль предка. Носитель этой фамилии с высокой долей вероятности происходил из среды мещан или казаков, занимавшихся торговлей или промыслами. Сейчас фамилия распространена в центральных и восточных областях Украины, а также среди потомков украинских переселенцев в России.