Фамилия Шиожинис — редкий случай, когда написание и произношение почти полностью совпадают с исходной формой, но эта форма совершенно не характерна для русской ономастики. С первого взгляда ясно: перед нами не исконно русская фамилия, а результат адаптации иноязычной модели. Суффикс -ис, а также сочетание гласных в корне указывают на литовское или, реже, латышское происхождение. В литовском языке фамилии мужского рода в именительном падеже часто оканчиваются на -ис, -ас, -а, а женского — на -е, -уте, -айте. Шиожинис — это, скорее всего, литовская фамилия, записанная кириллицей практически без изменений.

Корень фамилии — Šiožin- или Šiaužin-. В литовском языке есть слово «šiaudinis» (соломенный), но более вероятна связь с глаголом «šiuožti» — «скользить», «тащить», «волочить». Прозвище Šiuožinis или Šiožinis мог получить человек с характерной походкой, либо тот, кто занимался волоком грузов — например, перевозчик на санях или лодке. Вторая версия отсылает к диалектному «šiožė» — «коса» (инструмент), что делает предка косцом или крестьянином, работающим на сенокосе. Обе трактовки укладываются в крестьянский быт Великого княжества Литовского, где такие прозвища были обычны.

С точки зрения словообразования, суффикс -inis в литовском языке образует прилагательные со значением «сделанный из» или «относящийся к». Шиожинис буквально означает «относящийся к Шиожису» или «сын Шиожиса». То есть это патроним, но оформленный не русским суффиксом -ов/-ев, а литовским окончанием, указывающим на принадлежность к роду. Если бы фамилия русифицировалась, она могла бы звучать как Шиожин или Шиожинский, но этого не произошло — носители сохранили оригинальную форму.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи: современная Литва, запад Беларуси, частично Польша и Калининградская область. В России Шиожинис — крайне редкая фамилия, встречающаяся единичными семьями, чаще всего потомками литовцев, переселившихся в Сибирь или на Дальний Восток в ходе столыпинской реформы или депортаций 1940-х годов. Сословно предки, скорее всего, были крестьянами или мелкими ремесленниками, поскольку литовское дворянство (шляхта) обычно носило фамилии на -ский/-цкий.

В написании фамилии возможны варианты: Шяожинис, Шяуженис, Шиужинис — в зависимости от диалекта и способа передачи литовских звуков русскими буквами. Но форма Шиожинис закрепилась как основная в паспортных данных. Это хороший пример фамилии, которая не потеряла национальной окраски и не была переделана на русский лад, а значит, её носители дорожили своим происхождением и не стремились раствориться в чужой среде.