Фамилия Шишингарин — редкая, и её разбор стоит начать с самого заметного элемента: суффикса -ин. В русской антропонимии этот суффикс указывает на принадлежность: «чей?» — «Шишингарин» значит «сын Шишингара» или «человек из семьи Шишингара». Основа, в свою очередь, — прозвище или дохристианское имя Шишингар. Само слово «шишингар» в русских говорах не фиксируется, но его можно разложить на две части: «шиш» и «ингар».

«Шиш» в русских диалектах — многозначное слово. Это и острый предмет (шип, кол), и мелкий бес, и бродяга, и лазутчик (отсюда «шиш» — разведчик, а также «шиши» — разбойники). В некоторых говорах «шишом» называли нищего или попрошайку. Вторая часть — «ингар» — явно нерусского происхождения. Вероятнее всего, это тюркский компонент. В тюркских языках, особенно в татарском и башкирском, есть корень «ин(г)» со значением «широкий, просторный», а также суффикс «-гар», образующий прилагательные и существительные. Однако более прямолинейная версия: «ингар» — искажённое «ингер» или «ингерманландец»? Для фамилии Шишингарин такое объяснение слишком натянуто.

Самая правдоподобная гипотеза: Шишингар — это прозвище, собранное из русского корня и тюркского суффикса, что типично для зоны смешанного русско-тюркского населения (Поволжье, Приуралье, южные степи). «Шиш» могло означать «острый на язык» или «верткий, как шило», а «-гар» — усилительную или прозвищную частицу. В итоге Шишингар — «тот, кто шишом (острым, бойким) родился». Либо фамилия восходит к топониму: на карте России есть несколько мелких речек и урочищ с названием Шишинга, но это скорее вторично.

Географически фамилия тяготеет к югу России и Уралу. В современных базах данных Шишингарины встречаются в Оренбургской, Челябинской областях и в Башкортостане. Это указывает на возможное происхождение из среды оренбургских казаков или крестьян-старообрядцев, которые нередко заимствовали тюркские прозвища.

Словообразовательная модель проста: прозвище → фамилия на -ин. Никаких дворянских приставок или суффиксов -ский здесь нет, что говорит о крестьянском или мещанском корне. Носитель фамилии Шишингарин — потомок человека, которого в XVII–XVIII веках за острый язык или бойкий нрав прозвали Шишингаром. Фамилия сохранилась в узком ареале, не став массовой, и сегодня её можно считать редкой и локальной.