Фамилия Шиширюхин — редкая, и её разбор требует внимания к нестандартной словообразовательной модели. Она явно происходит от прозвища или имени Шиширюха, которое, в свою очередь, образовано от основы «шиш» с помощью сложного суффикса -юх- (как в фамилиях Грязюхин, Костюхин). Суффикс -ин в конце указывает на принадлежность: «чей?» — сын Шиширюхи.

Корень «шиш» в русских говорах многозначен. Самое распространённое значение — «острый предмет», «кол», «шип», а также «шишка» (нарост). Однако в ономастике чаще встречается другое: «шиш» — это бродяга, беглый каторжник, вор или вообще плутоватый человек. В диалектах «шишом» называли и лешего, нечистую силу. Прозвище Шиширюха могло означать человека с заметной внешностью (например, с шишкой на теле) или, что правдоподобнее, даваться по характеру — хитрому, острому на язык или склонному к воровству.

Есть и другая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование. В некоторых регионах «шиширить» означало «шептаться», «сплетничать», «наушничать». Тогда Шиширюха — это ябеда или сплетник. Но связка с суффиксом -юх- здесь слабее: он чаще образует прозвища от личных имён (Костюха от Константин) или от глагольных форм, а не от существительных.

География фамилии сугубо локальная. Шиширюхины встречаются в основном в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской и Архангельской губерниях, где диалектное слово «шиш» было в ходу. Сословно это почти наверняка крестьянская фамилия: она не попала в дворянские родословные книги и не встречается среди духовенства. Фамилия не имеет отношения к украинскому или белорусскому языку — типично русская по форме.

Таким образом, носитель фамилии Шиширюхин может считать, что его предок получил прозвище за остроту характера, сомнительные занятия или просто за какую-то заметную «шишку» — физическую или метафорическую. Точное значение сегодня восстановить сложно, но ясно одно: прозвище было ярким и нелестным, что в крестьянской среде было нормой.