Фамилия Шишверина — женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Шишверин. Это относительно редкая фамилия, и её разбор сразу наталкивает на вопрос: что за основа «шишвер»? Слово не из активного словаря, и здесь возможны два основных пути.

Первый и самый прямой — связь с диалектным словом «шишвер», которое в некоторых говорах означало нечто вроде «ерунда, пустяк, чепуха», а также могло относиться к неопрятному или суетливому человеку. В таком случае прозвище Шишвер дали человеку с определёнными чертами характера или поведения. По модели образования фамилия типична для северных и центральных областей России: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?») — сын Шишвера, то есть Шишверин.

Вторая версия, менее очевидная, но имеющая право на существование, — искажение или переосмысление более древнего имени. В старых русских документах встречается имя Шиш (уменьшительное от Шишмарь или Шишак), а суффикс -вер мог быть диалектной приставкой или результатом народной этимологии. Однако эта гипотеза слабее, так как не подкреплена устойчивыми параллелями в ономастике.

Географически фамилия Шишверин (и, соответственно, Шишверина) встречается в основном в Вологодской и Архангельской областях, что косвенно подтверждает диалектное происхождение: севернорусские говоры богаты на слова с корнем «шиш-» (шиш, шишкарь, шишак) и на суффиксальные прозвища.

Таким образом, предок современных Шишвериных, скорее всего, получил прозвище Шишвер за какую-то бытовую особенность — возможно, за несерьёзность или, наоборот, за склонность к пустым хлопотам. Фамилия сохранила живую народную речь, и в этом её ценность: она не книжная, не заимствованная, а вышедшая прямо из говора.