Фамилия Шкаунман — редкий случай на стыке немецкой и восточноевропейской ономастики. В ней сразу бросается в глаза модель, типичная для немецких фамилий: основа + компонент -ман (нем. Mann — «человек, мужчина»). Такие фамилии (Шульцман, Циммерман, Фишерман) в России часто получали немцы-колонисты, переселившиеся в XVIII–XIX веках, или их обрусевшие потомки. Однако первая часть — Шкаун — не является распространённым немецким словом или именем.

Наиболее вероятное объяснение: основа восходит к немецкому диалектному Schkaun или Schkaunert, что связано с глаголом schauen (смотреть, глядеть). В южнонемецких говорах (баварском, швабском) слово Schkaun могло означать «зоркий», «наблюдатель», а в некоторых контекстах — «сторож» или «дозорный». Тогда Шкаунман — это «человек, который смотрит», то есть сторож, смотритель или, возможно, прозвище для подозрительного, всё замечающего человека. В пользу этой версии говорит и то, что фамилии с компонентом -ман в немецкой среде часто образовывались от прозвищ, описывающих характер или профессию.

Менее правдоподобная, но встречающаяся гипотеза — связь с польским или украинским словом шкауна (от нем. Schaum — пена), якобы означавшим «пенщик» или «мыловар». Но в польских и украинских говорах такого слова с устоявшимся значением нет, а в немецком Schaum дало бы фамилию Шауман, а не Шкаунман. Поэтому версия с «наблюдателем» надёжнее.

В России фамилия Шкаунман встречается крайне редко, преимущественно в регионах, где исторически селили немецких колонистов: Поволжье, юг Украины, Западная Сибирь. Из-за редкости и нестандартного написания её нередко искажали в документах — встречаются варианты Шкаун, Шкауман, Шкаунер. Носители фамилии, скорее всего, потомки немецких поселенцев, которые либо занимались сторожевым делом, либо получили прозвище от односельчан за свою внимательность. По сословной принадлежности это были преимущественно крестьяне или ремесленники, а не дворяне.