Фамилия Шкеев — редкая и неочевидная. Её основа, корень «шк-», сразу отсекает большинство типичных для русских фамилий вариантов — она не от крестильного имени вроде Иван или Пётр. Чтобы понять, кем мог быть предок, придется разбирать прозвище.

Словообразовательная модель простая: суффикс -ев указывает на патроним (отчество) или принадлежность («чей?»). Основа — «Шкей». Это и есть прозвище. В русских говорах слово «шкей» или «шкея» имеет несколько значений, но главное — так называли человека неопрятного, неряху, грязнулю. В словаре Владимира Даля «шкея» — это «грязный, неопрятный человек». Прозвище, конечно, не лестное, но в крестьянской среде давали его без злого умысла, по внешнему признаку: кто-то постоянно ходил в замасленной одежде, работал с сажей или дёгтем.

Менее вероятная, но возможная версия — от тюркского имени или прозвища. В татарском и башкирском языках есть корень «шк» (например, «шәкерт» — ученик, или «шәк» — сомнение), но фамилия Шкеев не характерна для тюркских народов — у них обычно другие суффиксы. Скорее всего, перед нами чисто русская фамилия, возникшая в среде, где прозвища давали по бытовым качествам.

Географически фамилия встречается рассеянно, без явного гнезда. Можно предположить, что её носители — выходцы из центральных или северных губерний России, где слово «шкея» было в ходу. В официальных документах XVIII–XIX веков такие прозвища часто «облагораживали»: при записи в ревизские сказки могли убрать грубый оттенок, но корень остался.

Сравните с однокоренными: Шкелев, Шкенёв, Шкаев. Все они редкие и, вероятно, восходят к той же основе — «шкель» (неряха) или «шкать» (брезговать, гнушаться). Шкеев стоит в этом ряду как наиболее лаконичный вариант.

Кем был первый Шкеев? Скорее всего, крестьянином или ремесленником, которого за глаза дразнили неряхой. Прозвище закрепилось за детьми, а потом стало фамилией. Никакого знатного рода или дворянского герба за ней не числится — это фамилия-характеристика, каких в России тысячи.