Фамилия Шханокова — женская форма фамилии Шханоков, и чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант. В основе лежит корень «Шхан-», который сразу указывает на адыгское (черкесское) происхождение. В адыгских языках «шхан» (шхъэн) означает «есть, принимать пищу», а в более широком смысле — «кормилец», «тот, кто добывает пропитание». Фамилия образована по распространённой на Кавказе модели с суффиксом -ов/-ев, который в XIX–XX веках добавляли к местным именам и прозвищам при русификации, чтобы вписать их в российскую паспортную систему. Таким образом, Шханоков — это «сын (или потомок) Шхана», где Шхан — личное имя или прозвище.

Вероятнее всего, прозвище Шхан дали человеку, который был главным кормильцем в семье, щедрым хозяином или отличался хорошим аппетитом. В адыгской культуре, где гостеприимство и забота о пропитании гостя считались добродетелью, такое прозвище могло быть почётным. Реже, но возможно, что корень связан с тюркским «шан» (слава, почёт) — тогда фамилия означала бы «потомок славного», но адыгская версия выглядит убедительнее из-за географической привязки.

Фамилия Шханокова распространена в Кабардино-Балкарии и Карачаево-Черкесии, а также среди черкесской диаспоры за рубежом (в Турции, Сирии, Иордании). Встречается вариант написания с одной «к» — Шханова, но форма с суффиксом -оков типична для адыгских фамилий, где -ок- — уменьшительный или патронимический элемент (ср. Бжохоков, Хапоков). Носительницы фамилии — в основном потомки адыгских (черкесских) узденей (свободных крестьян) или дворян, так как в сословной структуре черкесов прозвища, связанные с бытом, нередко закреплялись за разными слоями, но точных данных о принадлежности к конкретному сословию нет.