Фамилия Шкокова — женская форма фамилии Шкоков, и её разбор стоит начать с мужского варианта. Основа «шкок» в русских говорах имела несколько значений, и самое вероятное из них — диалектное слово «шкок» в значении «скачок, прыжок» или «удар». В некоторых областях так называли неспокойного, вертлявого человека, а в других — того, кто наносил удары, задиру. Таким образом, прозвище Шкок мог получить либо непоседа, либо драчун. Менее распространённая версия связывает фамилию с украинским или белорусским «шкокати» — щёлкать, цокать, но для фамилии с суффиксом -ов это менее типично: -ов чаще присоединялся к русским основам.

По словообразовательной модели Шкоков — типичная патронимическая фамилия, образованная от прозвища через притяжательный суффикс -ов. Она отвечает на вопрос «чей сын?»: сын Шкока. Географически фамилия Шкоков и её женская форма Шкокова встречаются нечасто, но прослеживаются в нескольких регионах: есть записи в Воронежской, Ростовской областях, а также на Кубани — зонах, где оседали выходцы из южнорусских губерний. Это косвенно подтверждает связь с южнорусскими говорами, где слово «шкок» было в ходу.

Встречается и вариант написания «Шкаков» — с буквой «а» в корне. Это не ошибка, а отражение акающего произношения: в безударной позиции «о» звучало как «а», и при записи фамилии в документах могли зафиксировать именно звуковой вариант. Поэтому для некоторых ветвей рода возможна двойная орфография, но исходная форма — через «о».

Сословная принадлежность предков Шкоковых не зафиксирована в массовых источниках, но судя по прозвищному происхождению, скорее всего, это крестьянская или мещанская фамилия. Дворянские роды с такой фамилией в гербовниках не значатся. В любом случае, прозвище Шкок — яркое и образное, оно даёт представление о характере первого носителя: живого, резкого, возможно, не без озорства.