Фамилия Шкрябатовская — редкий пример, когда исходное прозвище звучит почти как звукоподражание, а фамилия, образованная от него, — как топоним. Корень здесь — «шкряб-», который в южнорусских и украинских говорах означал «царапать», «скрести», «чесать». Отсюда «шкрябати» — чесать, скрести, а «шкряба» — тот, кто скребет, царапает. В переносном смысле так могли назвать человека скребущего, то есть прижимистого, скупого, или же просто неряшливого, который ходит, задевая всё подряд, шкрябая. Есть и более прозаичная версия: «шкрябать» — работать скребком, например, счищать кору с дерева или кожу с туши. Тогда прозвище Шкрябата (или Шкрябат) мог получить кожевник, бондарь или плотник, чья работа связана с постоянным скоблением.

Фамилия образована по польско-украинской модели с суффиксом -овский/-евский. Формант -ский изначально указывал на принадлежность к месту или роду: Шкрябатовский — «сын или потомок Шкрябатого», либо «выходец из селения Шкрябатовка». Второй вариант правдоподобнее, потому что фамилии на -ский в массе своей — дворянские или шляхетские, но в XIX веке их активно давали и крестьянам, переезжавшим из деревни в город. В данном случае Шкрябатовский — почти наверняка потомок того, кто жил в местечке или хуторе, названном по первому поселенцу Шкрябата.

Ударение, скорее всего, падает на второй слог от конца: Шкрябато́вская. Встречаются варианты написания — Шкряботовская, Шкрябатовская, а также упрощённые формы вроде Шкрябацкая. Фамилия географически привязана к западным и юго-западным регионам бывшей Российской империи: Украина (особенно Правобережье), Беларусь, юг России. В современных документах она редка, носители рассеяны, но не образуют крупных гнезд. Сословное происхождение — скорее всего, мещанское или однодворческое, хотя не исключена и запись в казачьи реестры.

Родственными по корню будут фамилии Шкрябин, Шкрябко, Шкрябун, Шкряба. Все они восходят к тому же глаголу «шкрябать», но различаются суффиксами, которые указывают на разные диалектные формы прозвищ. Если Шкрябатовская — самая «длинная» и книжная, то Шкрябко — типично украинская, уменьшительная.