Фамилия Шкрыголов — редкая и звучит необычно, что сразу наводит на мысль о прозвищном происхождении. В основе лежит составное прозвище из двух частей: «шкрыга» и «голова». Первая часть, «шкрыга», — диалектное слово. В южнорусских и украинских говорах «шкрыга» или «скрыга» означала «скупец», «скряга», а также могла относиться к человеку скупому, жадному, «зажимистому». Вторая часть — «голова» — типичный компонент для прозвищ, описывающих умственные способности, характер или внешность человека. Получается, что Шкрыголов — это «скупая голова», то есть человек, которого в окружении считали прижимистым, расчетливым до крайности.

Модель образования фамилии — типичная для русских фамилий на -ов. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей?» — Шкрыголов, то есть сын или потомок человека по прозвищу Шкрыга (или Шкрыголова). Полная форма прозвища могла звучать как «Шкрыга-голова» или «Шкрыголова», а фамилия закрепилась уже в усеченном виде. Сравните с другими фамилиями той же модели: Сухоруков, Кривошеев, Белобородов — все они образованы от прозвищ, описывающих внешность или характер.

География фамилии, судя по современным данным, сосредоточена на юге России и в Украине. Встречается в Ростовской, Волгоградской областях, а также в Краснодарском крае. Это подтверждает южнорусские корни слова «шкрыга». В северных и центральных регионах России фамилия почти не фиксируется. Сословно носители, скорее всего, были из крестьян или казаков: прозвища такого типа в среде простого народа давали метко и без прикрас.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: связь с украинским словом «шкрига» — «льдина», «глыба». Тогда Шкрыголов могло означать «голова, твердая как лед» или «упрямый, как глыба». Но эта гипотеза слабее, так как слово «шкрига» в значении «льдина» редко использовалось для прозвищ, а «скупец» — типичная бытовая характеристика. Поэтому версия со скупостью — основная и правдоподобная.

Фамилия не попала в дворянские родословные книги и не связана с известными историческими личностями. Это редкий пример народного прозвища, которое сохранилось в неизменном виде благодаря своей яркости и звуковой цепкости.