Скорее всего, оно восходит к диалектному «скрыль» - «щепа, лучина». Вероятно, Шкрылем прозвали того, кто изготовлял лучину. Согласно другой версии, это прозвище имеет в своей основе глагол «скрылиться» - «захилеть», «обеднеть». В этом случае Шкрыль – больной, либо разорившийся человек. Чередование с/ш характерно для южных говоров, а также для украинского и белорусского языков.