Фамилия Шлепаховский звучит как типичная польская или западнорусская фамилия с суффиксом -ский, который в старину указывал на принадлежность к месту или шляхетскому роду. Однако её основа — «шлепах» — ставит этимолога в тупик: в литературном русском языке такого слова нет, а в польском есть глагол szlepać (тащить, волочить) и просторечное szlepa (тряпка, неопрятная женщина). Наиболее вероятно, что прозвище Шлепах дали человеку с медленной, шаркающей походкой или тому, кто ходил в рваной обуви, «шлёпал» по грязи.

Модель образования типична для землевладельческой шляхты: основа Шлепах + суффикс -ов + окончание -ский. Первоначально это было прилагательное от названия имения или хутора Шлепахово — «выходец из Шлепахова». Такие топонимы могли возникнуть от фамилии первого владельца (Шлепах) или от характерного признака местности (топкое, «шлёпающее» болото). На территории современной Польши существует деревня Szlepy (Шлепы) в Мазовецком воеводстве, а на Украине — село Шлепакове в Харьковской области, что указывает на географию бытования.

Версия о происхождении от немецкого Schlapphut (шляпа с опущенными полями) или Schlafrock (халат, шлафрок) — натяжка: для адаптации в славянской среде потребовались бы дополнительные суффиксы, а фамилия Шлепаховский слишком «славянская» по структуре. Более правдоподобно, что в основе лежит диалектное слово шлепаха — так в некоторых регионах называли большую деревянную лопату для хлеба или шлепок (пощёчина). В таком случае прозвище могло относиться к булочнику или драчуну.

Фамилия встречается в основном в Беларуси, на западе Украины и в восточной Польше — то есть в зоне, где смешивались польская шляхетская культура и восточнославянские говоры. Сословно носители, скорее всего, были мелкой шляхтой или однодворцами, а не крестьянами: суффикс -ский в XVII–XVIII веках закрепился именно за дворянскими и полупривилегированными группами, тогда как простые крестьяне получали фамилии на -ов, -ин без элитарного окончания.