Фамилия Шмоян — типичный пример армянской модели фамилии, образованной с помощью суффикса -ян (в диаспоральном варианте также -янц, -енц). Этот суффикс в армянской ономастике выполняет ту же роль, что русские -ов/-ев или -ин: он указывает на принадлежность к роду или происхождение от предка. Буквально Шмоян означает «из рода Шмо» или «потомок Шмо».

Основа фамилии — личное имя или прозвище Шмо. В армянском языке имя Шмо (иногда в формах Шма, Шмуэл) — это народная, сокращённая форма библейского имени Самуил (арм. Самуэл, Самвел). Самуил в переводе с древнееврейского означает «услышанный Богом» (шема Эль). Имя было широко распространено среди армян-христиан, особенно в Западной Армении (исторические области Васпуракан, Ахдзник) и среди армянской диаспоры. Таким образом, фамилия Шмоян — патронимическая, то есть образованная от личного имени отца или основателя рода.

Встречается и альтернативная, менее вероятная версия: связь с диалектным армянским словом «шмо» — «туман», «мгла». В таком случае прозвище Шмо мог получить человек с рассеянным взглядом или неясным, «туманным» характером. Однако эта гипотеза слабая: ономастические словари (например, работы А. Акопяна по армянским фамилиям) указывают на библейское происхождение как основное, а прозвище от природного явления встречается в армянской антропонимии крайне редко.

Географически фамилия Шмоян чаще всего фиксируется среди армян, происходящих из Западной Армении (ныне территория восточной Турции), а также в среде армянской диаспоры — в России, Грузии, Ливане, Сирии. В России носители фамилии встречаются в Краснодарском крае, Ставрополье, Ростовской области и Москве — регионах исторического расселения армян. Написание фамилии стабильное, без вариантов вроде Шмоянц или Шмоенц, что указывает на её относительно позднюю фиксацию в документах (конец XIX — начало XX века), когда суффикс -ян уже вытеснил диалектные формы.

Интересная деталь: в отличие от многих русских фамилий, которые за столетия могли изменить звучание, армянские фамилии на -ян сохраняют прямую связь с именем предка. Носитель фамилии Шмоян может с высокой вероятностью предположить, что его предок по мужской линии носил имя Шмо (Самуил), и это имя передалось роду как родовое прозвание.