Фамилия Шмяков образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей: от прозвища или имени, оканчивающегося на твёрдый согласный, с помощью суффикса принадлежности -ов. Вопрос лишь в том, что лежит в основе — слово «шмяк».

Прямое значение глагола «шмякать» — ударять чем-то мягким, падать с глухим звуком. Вряд ли прозвище Шмяк дали человеку за его походку или привычку ронять вещи. Скорее всего, перед нами диалектное или профессиональное слово, которое в разных говорах означало нечто конкретное. В псковских и тверских говорах, например, «шмяк» — это удар, оплеуха, а также звук от падения. Но есть и другая версия: в некоторых регионах «шмяком» называли неуклюжего, медлительного человека, «шлёпу» или «размазню». Тогда фамилия уходит в характеристику характера — прозвище закрепилось за человеком флегматичным или нерасторопным.

Менее очевидная, но возможная версия — связь с диалектным «шмяк» в значении «пятно», «клякса» (от глагола «шмякать» — пачкать, марать). В этом случае прозвище мог получить неряшливый человек или тот, кто работал с краской, глиной, чернилами. Такая версия не менее правдоподобна, чем первая, и хорошо объясняет, почему фамилия не превратилась в более «благозвучные» варианты.

С точки зрения географии фамилия Шмяков встречается нечасто, но имеет выраженный «северный» след — большинство носителей исторически проживали в Вологодской, Архангельской и Кировской областях. Это косвенно подтверждает версию о диалектном происхождении: именно в северных и северо-восточных русских говорах слово «шмяк» бытовало в значении «удар» или «неуклюжий человек».

Встречаются также единичные варианты написания Шмяковъ (с твёрдым знаком на конце) — дореволюционная орфография, не меняющая сути фамилии. Родственными по корню можно считать фамилии Шмякин (от основы на -я) и Шмяковский (с польским или украинским суффиксом), но они ещё более редки.

Таким образом, предок современных Шмяковых, скорее всего, получил прозвище за манеру поведения (медлительность) или за род занятий (работа с пачкающими материалами). Фамилия не относится к числу знатных или дворянских — это типичная крестьянская или посадская фамилия, возникшая не позднее XVII–XVIII веков.