Фамилия Шмытикова — женская форма фамилии Шмытиков, и её происхождение стоит искать в прозвище, которое дали предку. Основа фамилии — «шмыть» или «шмыга», слово с ярким звукоподражательным оттенком. В русских говорах «шмыгать» означало двигаться быстро, юрко, с шорохом, а также — тереть, стирать. Прозвище Шмыга или Шмыт могли дать человеку подвижному, непоседливому, который всё делал быстро и незаметно. Вторая, более конкретная версия, связывает фамилию с диалектным словом «шмыт» — в некоторых регионах так называли мелкую рыбу, например, снетка или уклейку. В этом случае предок мог получить прозвище за худобу или за то, что ловил или торговал такой рыбой.

Суффикс «-ов» в основе указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ или мирских имён, заканчивающихся на твёрдый согласный. Форма Шмытикова — притяжательное прилагательное, отвечающее на вопрос «чья?», то есть «дочь или жена Шмытика». Вариант с суффиксом «-ик» (Шмытик) — уменьшительная форма прозвища, которая могла закрепиться за младшим в семье или за человеком, носившим то же прозвище, что и старший родственник.

Фамилия редкая, сконцентрирована преимущественно в северных и центральных областях России — в Вологодской, Костромской, Кировской областях, где диалектная лексика с корнем «шмыг-» была особенно употребительна. Встречается и в Сибири, куда переселенцы принесли прозвище с собой. Социальный состав носителей, судя по архивным данным XIX века, — в основном крестьяне и мещане, что типично для фамилий, образованных от бытовых прозвищ.

Есть и менее правдоподобная версия, связывающая фамилию с украинским или белорусским «шмыт» — «мусор, отбросы», но для русской ономастики она нехарактерна, так как суффикс «-ов» в таком случае указывал бы на иную географию. Спорные гипотезы, вроде связи с еврейским «шмит» (от идиш — «защита»), не имеют под собой реальной основы: фамилия Шмытиков типично славянская по модели и распространению.