Фамилия Шнепо — редкий случай, когда суффиксальная модель почти не работает. В ней нет типичных русских окончаний -ов, -ин или -ский. Это указывает на позднее, часто искусственное закрепление фамилии в письменных документах, либо на её нерусское происхождение, которое адаптировали без переоформления.

Самая прямая версия — немецкая основа. В немецком языке Schneppe означает «носик» (чайника, кувшина) или «клюв». Прозвище Schneppe мог получить человек с длинным или острым носом, либо мастер, делавший носики для сосудов — лудильщик или жестянщик. В пользу немецкого корня говорит и фамилия Шнеппе, встречающаяся у поволжских немцев и в Прибалтике. Форма Шнепо могла возникнуть из-за оглушения конечного согласного в устной речи или при записи в русских канцеляриях.

Есть и другая, менее очевидная линия. В польском и украинском языках есть слово «шнепа» — пренебрежительное название носа (сравните с русским «шнобель»). В этом случае фамилия — чисто прозвищная, с тем же значением «носатый». Однако географически фамилия Шнепо почти не встречается в польских метриках, что делает немецкую версию убедительнее.

Фамилия крайне редкая. В современной России она сосредоточена в основном в Краснодарском крае и в Москве — что косвенно подтверждает связь с немецкими колонистами, которых в XIX веке переселяли на юг империи. Никаких известных дворянских родов или массовых сословных групп с этой фамилией не зафиксировано. Скорее всего, предки носителя фамилии были ремесленниками или крестьянами немецкого происхождения, а сама фамилия — это прозвище, закрепившееся за чертой внешности или за профессией.