Фамилия Шнигурова — женская форма от Шнигуров, и её разумнее всего разбирать через мужской вариант. Сразу бросается в глаза необычная основа: «шнигур» не встречается ни в современных словарях русского литературного языка, ни в распространённых списках профессий. Это указывает на диалектное или заимствованное происхождение. Наиболее вероятная версия связывает фамилию с южнорусскими или украинскими говорами, где «шнигур» (или «шнигирь») — народное название птицы снегирь. Переход «е» в «и» и замена «гирь» на «гур» — типичное явление для некоторых говоров: так слово адаптировалось под местную фонетику. Таким образом, Шнигуров — это «снегирёв», то есть прозвище по птице.

Прозвища по птицам в русской традиции давали по разным причинам. Чаще всего — за внешнее сходство: яркую одежду, румянец, осанку. Снегирь — птица заметная, спокойная, с красной грудкой, поэтому прозвище могло закрепиться за человеком с румяным лицом или любящим яркую, нарядную одежду. Могли прозвать и за характер: снегири несуетливы, даже флегматичны, так что прозвище могло отражать медлительность или степенность.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ или имён, оканчивающихся на твёрдый согласный. Фамилия Шнигуров — не дворянская, а крестьянская или мещанская, возникшая в среде простых людей, где прозвища были обычным делом. Географически фамилия тяготеет к югу России и Украине, встречается в Воронежской, Ростовской областях, а также в Белгородчине. Встречается и вариант Шнигур без суффикса — он характерен для западных регионов, где фамилии часто оставались в виде чистого прозвища.

Есть и другая, менее правдоподобная версия: от немецкого или еврейского корня. В немецком Schnur — «шнур, верёвка», а в идише есть слово «шнир» с похожим значением. Но тогда фамилия скорее звучала бы как Шнуров или Шниров. Появление буквы «г» в середине трудно объяснить без натяжек, поэтому версия с птицей выглядит убедительнее. Как бы то ни было, фамилия Шнигурова — редкий пример того, как диалектное произношение обычного слова закрепилось в официальном родовом имени.