Фамилия Шнотин — одна из тех, что звучит необычно для русского уха, но при этом имеет вполне прозрачную словообразовательную структуру. В ней выделяется основа Шнот- и патронимический суффикс -ин, который в русской традиции указывает на принадлежность: «чей?» — Шнотин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Шнот.

Корень здесь — главная загадка. Слово «шнот» не встречается в современном русском литературном языке. Однако оно хорошо известно в диалектах. В северо-западных и псковских говорах «шнот» или «шнет» — это мелкая рыбёшка, снеток. Снеток был важной промысловой рыбой на Псковском и Чудском озёрах, его сушили и продавали по всей России. Прозвище Шнот могли дать либо рыбаку, либо человеку маленького роста или щуплого телосложения — по аналогии с мелкой рыбкой. Такая модель прозвищ от названий рыб («Ерш», «Окунь», «Карась») в русской ономастике обычна.

Есть и другая, менее вероятная версия. В некоторых западных говорах «шнот» могло быть искажением слова «шнобель» (нос) или звукоподражательным прозвищем для того, кто шмыгает носом. Но эта гипотеза слабее, так как не имеет широкой диалектной поддержки. Основная и самая правдоподобная версия — рыболовная, с привязкой к Псковщине или Новгородчине.

Фамилия Шнотин — редкая. Её носители встречаются в основном на северо-западе России, что подтверждает диалектное происхождение. По модели образования она типична для крестьянских фамилий: суффикс -ин указывает на то, что фамилия закрепилась в среде, где было принято называть человека по отцу или по прозвищу главы семьи. В дворянской среде такие фамилии почти не встречались — там преобладали формы на -ов/-ев и -ский. Таким образом, предки современных Шнотиных, скорее всего, были простыми людьми, возможно, рыбаками или крестьянами из-под Пскова.